Zanna und Zink haben sich zurück in ihr neues Heim in einem Wasserturm begeben, wo sie von Alopex und Angel über Mushrooms Verbleib ausgefragt werden; doch die beiden Wieselkinder sind von ihrem Erlebnis noch zu verängstigt, um irgendwelche klaren Antworten geben zu können.[1]Raphael, der der Spur der Kinder gefolgt ist, um Mushroom zu helfen, mischt sich ein und beginnt Alopex zu erzählen, was passiert ist. Doch kaum hat er damit angefangen, überschüttet Alopex ihn sogleich mit haltlosen Vorwürfen und gibt ihm die Schuld an Mushrooms Kidnapping. Das bringt Raphaels Temperament zum Aufkochen, doch Alopex lässt sich von seinen Worten nicht beschwichtigen, seitdem sie ihr Vertrauen in den Splinter Clan verloren hat.[2] Selbst Angels Einmischung kann sie nicht beschwichtigen, und sie beschließt, die Sache auf eigene Faust zu klären.
Besessenheit
Etwas später, im Versteck, klopft Leonardo rigoros gegen die Tür von Donatello, der sich in der letzten Zeit nur noch in seinem Labor aufhält, um ihn für die Suche nach Mushroom zu rekrutieren. Als Donatello die Tür schliießlich einen Spalt weit öffnet, erzwingt sich Leonardo seinen Weg ins Innere und beginnt sich die Aufzeichnungen seines Bruders anzusehen, um den Grund für seine neueste Isolation zu erfahren. Donatello schaltet sofort auf stur und versucht zu erklären, dass seine Nachforschungen viel zu wichtig sind, um sie zu vernachlässigen, ohne seinem Bruder jedoch den genauen Grund zu nennen. Raphael tritt ein und versucht zu schlichten; doch als Donatello ihn ungeduldig von sich stößt, explodiert Raphaels Frust in Wut, und er und Donatello liefern sich eine handfeste Prügelei, in die auch Leonardo verwickelt wird.
Der große Streit
Als sie dann aber ihre Freunde - Michelangelo, April und Lita - erblicken, wie sie dem Kampf erschrocken zuschauen, kommen die drei Steithähne wieder zur Besinnung; doch der Schaden ist bereits getan, und Michelangelo und April verlassen den Bunker zusammen mit Lita, gerade als Jennika nachhause kommt. Raphael geht nicht auf ihre Frage ein, was da gerade passiert ist, sondern macht sich, ohne auf Leonardo oder Donatello warten zu wollen, mit Jennika auf den Weg, um sich mit Angel zur Suche nach dem entführten Wieselmädchen zu treffen. Nun allein gelassen, gibt Donatello seinem Bruder eine klarere Antwort auf dessen vorherige Frage und erzählt ihm, was er über ihre Zukunft und das zeitreisende Monster mit dem Namen Armaggon erfahren hat.[3] Nachdem Leonardo gegangen ist, um seine Schüler Carmen und Bob für die Suche nach Mushroom heranzuziehen, versetzt Donatello sich in eine Trance und setzt seine Kuji-Kiri-Kraft frei, um mit der Zukunft Verbindung aufzunehmen und nach einem Weg zu suchen, Armaggon zu stoppen. Doch eine Stimme, die sich über diese Verbindung bei ihm meldet, gebietet ihm, jetzt und hier seinen Freunden zu Hilfe zu kommen.
Over the Radio
Michelangelo, April und Lita gehen währenddessen in den Straßen an der Oberfläche spazieren. Michelangelo gesteht April, dass er sich in der letzten Zeit zu orientierungs- und hilflos fühlt, um den anderen von irgendwelchem Nutzen sein zu können. Besonders was er über ihre kosmische Verbindung mit dem Universum und den Leuten um sie herum gelernt hat, hat ihn ziemlich aus der Fassung gebracht[4], und er fühlt sich nicht mehr seiner Sache und seinen Mitmenschen sicher. April aber versichert ihm, dass genau das Gegenteil der Fall ist - dass er mit seiner Radiosendung[5] wirklichen Einfluss auf die Leute in seiner Umwelt hat, die bereit sind, ihm zu helfen, wenn er sie darum bittet. So wendet er sich in Aprils Wohnung per seines Senders an seine Zuhörer, berichtet ihnen von der Mordserie an Mutanten[6] und bittet sie um jeglichen Hinweis, den sie liefern können. Und kaum hat er seine Ansprache beendet, kommt sogleich der erste Anruf.
Finstere Experimente
In seinem neuen Geheimlabor bereitet Dr. Barlow mit Leatherheads Kooperation ein neues Experiment mit der letzten Schuppe Des Drachen in seinem Besitz. Durch seine Experimente bei Venus' "Erschaffung" hat er das Potential der Magie, die in diesem Fragment steckt, kennengelernt[7] und beschlossen, sie für seine eigenen Pläne einzusetzen. Zu diesem Zweck hat er Leatherhead eine zu einem Totenschädel zurechtgeschnitztes Bruchstück in dessen Bauchhöhle eingepflanzt[8] und setzt sich nun ein weiteres Fragment in seinen Handrücken ein, um - wie er Leatherhead erklärt - mit dessen Hilfe einen Weg zu finden, Mutationen frei kontrollieren und damit auch Mutanten in ihre ursprünglichen Gestalten zurückverwandeln zu können. Diese Hoffnung passt Leatherhead ins Gewissen, da ihm seine Mutation als unnatürlicher Unfall verhasst ist.[9] Nachdem er Leatherhead weggeschickt hat, damit dieser seinen "Kreuzzug" gegen die Mutanten fortsetzen kann, macht Barlow sich an die Arbeit, Mushroom das letzte ihm verbliebene Stück der Drachenschuppe einzupflanzen. Gerade da melden ihm seine Lakaien Eindringlinge nahe seines Verstecks, und Barlow weist Leatherhead an, diese Störung zusammen mit den "Jungs" zu beseitigen.
FrankenBarlows Monster
Alopex verfolgt zusammen mit Zanna und Zink eine Geruchsspur in die Kanalisation hinunter. Als sie aber in die Nähe von Barlows Versteck kommen, bricht plötzlich eine Mauer auf und speit eine aus den Überresten von Groundchuck und Dirtbag[10]zusammengeflickte Monstrosität aus, die Alopex's Gruppe sofort angreift. Dann taucht auch Leatherhead auf, greift sich Zanna und will diese lebendig verschlingen; doch da meldet sich sein Gewissen wieder, und anstatt seinen Angriff fortzusetzen, verhilft er Alopex und den Wieseln zur Flucht, als diese sich geschlagen zurückziehen müssen.
Wie in alten Zeiten
Während Michelangelo, April und Mona im Studio von Turtle Tracks zahlreichen Hinweisen nachgehen, finden Raphael, Jennika und Angel Alopex und die beiden Wieselmädchen, die nur knapp dem Hinterhalt entkommen sind. Leonardo, Bob und Carmen begeben sich zum Schlachthaus, um von dort aus Leatherheads und Mushrooms Spur aufzunehmen, doch zu ihrer Überraschung treffen sie dort auf Donatello und einige von ihm herbeigerufene[11] weitere Freunde: Venus, Koya und Bludgeon. Da Venus über ihr eigenes Schuppenfragment bereits weiß, was Barlow zu tun gedenkt, machen die Freunde sich nun zu siebt auf, um den verrückten Chirugen zu stoppen. Jedoch kommt ihr Handeln bereits zu spät - Barlow hat Mushroom bereits das Schuppenstück in die Bauchdecke implantiert...
